组学整合构建玉米发育图谱

2016-09-01

2016年8月19日,美国Briggs SP等人在Science杂志发表玉米发育图谱。
共表达网络和基因调控网络是预测基因在系统水平功能作用的有力工具。研究人员构建玉米发育各个阶段的大规模组学数据库,囊括62547个mRNA,17862个未修饰蛋白和6227个磷酸化蛋白。通过mRNA相关表达模式构建的网络不同于蛋白质共表达网络,二者之间85%的高度连接节点是不保守的。然而,不同组学类型的网络富集到相似的功能类别,对于预测基因间调控关系均有效。整合不同组学数据的网络将大大提高基因调控网络的预测能力。

海腾评述:无论是动物还是植物研究领域,多组学整合的方法已经成为大规模研究的手段,能够揭示出系统水平的新知识。

参考文献:
Integration of omic networks in a developmental atlas of maize. Walley JW, Sartor RC, Shen Z, Schmitz RJ, Wu KJ, Urich MA, Nery JR, Smith LG, Schnable JC, Ecker JR, Briggs SP. Science. 2016 Aug 19; 353(6301):814-8. [PMID:27540173]