GSEA分析

GSEA (Gene Set Enrichment Analysis)即基因集富集分析,是Broad Institute of MIT and Harvard开发的工具。常用于样本两两之间比较差异显著富集的基因集。GSEA基于MSigDB (Molecular Signatures Database) 数据库中已有注释的基因集,主要分为8大类别:hallmark gene sets、positional gene sets、curated gene sets、motif gene sets、computational gene sets、GO gene sets、oncogenic signatures和immunologic signatures。